淹沒之城的劇本中姐姐miku帶著受傷的弟弟乘著摩托艇出現在玩家們的眼前，為了照顧和受傷的弟弟，miku不得不獨自一人開始在這淹沒之城中冒險，尋找食物，尋找藥物，揭開這座城市的秘密。跟隨著姐姐的視角，我們開始探索這座城市，在游戲中，我們將看到未知的海洋生物，爬滿青苔藤蔓的建筑，晴雨明暗的天氣時間變化，以及恐怖未知的城市居民。